سید محمد، سید علی، سید هادی و سید حسن) و یک دختر (بدری) شد.همسر سید محمد خامنه ای (برادر رهبری) درگذشت.
به گزارش عصرایران، حجت الاسلام سیدمحمد خامنه ای ( ۸۶ ساله – چهره اصولگرا و رئیس بنیاد ایران شناسی) در کنار حجت الاسلام سیدهادی خامنه ای (۷۴ ساله – فعال اصلاح طلب) و سیدحسن ( ۷۰ ساله – غیرروحانی و شاغل در وزارت نفت و وزارت ارشاد)، برادران آیت الله سیدعلی خامنه ای (۸۲ ساله – مقام معظم رهبری ) هستند. بدری تنها خواهر برادران خامنه ای است.
محمد مخبر معاون اول رئیس جمهوری در پیامی به حجت الاسلام سید محمد خامنه ای رییس بنیاد ایران شناسی، درگذشت همسر وی را تسلیت گفت.
از نام و جزییات زندگی و فوت همسر سیدمحمد خامنه ای خبری منتشر نشده است.
